دانشنامۀ نسخ خطی امامیه منبعی جامع برای پژوهشگران و عموم علاقه‌مندان به آثار امامیه، معرفی مؤلفان آن‌ها و شرح نسخه‌شناسانهٔ دست‌نویس‌های هر اثر است و در آن با توصیف هر نسخهٔ خطی اطلاعات دقیقی دربارهٔ تاریخچه، محتوا و ویژگی‌های آن ارائه شده‌است. کاربران می‌توانند با استفاده از این دانشنامه و با جستجوهای مختلف به‌راحتی به اطلاعات مورد نیاز خود دسترسی پیدا کنند.
در فاز نخست دانشنامه همهٔ نسخه‌های شناسایی‌شده و دستیاب‌شده از آثار امامیه که پیش از ۶۵۶ هجری (پایان دورهٔ عباسی) کتابت شده‌اند به‌تفصیل معرفی می‌شوند. برای هر مؤلف و هر یک از آثار او شرحی بین ۴۰۰ تا ۱۰۰۰ کلمه درنظر گرفته شده ولی به نسخه‌های هر اثر به‌تفصیل پرداخته می‌شود و همهٔ مسائل نسخه‌شناسی آن بررسی می‌شود.